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60秒完成病毒基因對比 阿里云向社會免費開放基因計算服務

0秒完成病毒基因對比

速途網3月13日訊(報道:喬志斌)今日,阿里云對外宣布,將向全球一線病毒研究機構免費開放基因計算服務,醫療科研機構、疾控中心等可在云上進行病毒基因比對,只需60秒即可完成包括新冠病毒在內的任意病毒基因對比工作,對進一步了解病毒變異提供有效依據。這是繼此前宣布AI算力免費后,阿里云再次用技術“搶奪”寶貴時間。

病毒經過數代傳播,會產生變異,追蹤掌握病毒變異情況成為科研人員的重中之重。宏基因組測序mNGS是目前較為有效的追蹤方案,配合病毒庫可精準確定病毒的代際關系,甚至找到病毒源發地。

但此前的mNGS數據分析較為耗時,以某新冠重癥患者為例,系統需要對2200萬個序列超過32億個堿基一一和病毒庫比對,檢測出新冠病毒特征區域的完全匹配系列,通常這一過程需要30分鐘或更久。

此次阿里云免費開放的基因計算服務AGS(Alibaba Genomics Service),采用容器技術和GPU,即開即用,可同時運行多個病毒基因比對服務,大大縮短了這一進程,60秒內即可獲取高質量的基因比對報告,為患者提供更為準確的醫療方案。

包括疾控中心、各大高校、醫院、基因企業等一線病毒研究機構可在阿里云上申請快速開通基因計算服務,為進一步研究病毒蛋白質及變異提供準確的數據支撐。

目前,國內基因公司安諾優達已開始借助阿里云的計算能力從某腫瘤樣本數據中尋找病毒相關序列的數據,用于研究病毒活動與某腫瘤發生的相關性。

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